[BioPython] Inverse codon table?

[Philipp Pagel]

	Hi!

> I need a table that I coulld enter "M" and get the all triples that
> translate into "M". Is this available in Biopyhon?

Hm - I'm not sure but it's easy enough to make one yourself:

>>> foo = {}
>>> for codon, AA in t.forward_table.items():
...     if AA not in foo:
...             foo[AA] = []
...     foo[AA].append(codon)
...
>>> foo['L']
['CTT', 'CTG', 'CTA', 'CTC', 'TTA', 'TTG']
>>> foo['V']
['GTA', 'GTC', 'GTG', 'GTT']

cu
	Philipp

-- 
Dr. Philipp Pagel                              Tel.  +49-8161-71 2131
Lehrstuhl für Genomorientierte Bioinformatik   Fax.  +49-8161-71 2186
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 and

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http://mips.gsf.de/staff/pagel