<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1264" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Hi,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>I would like to know how to run a remoteblast query 
using bioperl modules. I have looked in the FAQs but the instructions provided 
were for StandaloneBlast. I followed the instruction by received the following 
message:</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><BR>-------------------- WARNING 
---------------------<BR>MSG: cannot find path to 
blastall<BR>---------------------------------------------------<BR></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>I assume that you need to install blast on your 
local machine. </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>I am new to Bioperl. I don't know what modules to 
use?</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>How can I run a simple blast querry using 
NCBI?</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Thanks</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>ACGT</FONT></DIV></BODY></HTML>