[Bioperl-l] How to draw Phylogeny Tree using Bioperl ?
Shameer Khadar
shameer at ncbs.res.in
Mon Oct 1 12:57:15 EDT 2007
Dear All,
Is it possible to draw a phylogeny tree file in PNG format using Bioperl ?
My input file are in phylip treefile format. Any Modules / codes in
Bio::Graphics / Phylogeny sections ?
Input file :
((((((_L_537_539:3.70000,_H_535_536:3.70000):4.97461,(((((((_E_499_500:2.75000,_E_250_251:2.75000):0.55805,_L_252_254:3.30805):1.38576,_H_494_497:4.69381):1.51514,_H_255_263:6.20895):0.83877,(_L_246_249:4.30000,_H_244_245:4.30000):2.74772):0.92645,_H_520_534:7.97418):0.15279,(_H_502_512:6.95000,_H_273_282:6.95000):1.17697):0.54765):1.10967,_L_264_272:9.78428):0.53441,_L_283_291:10.31869):3.59264,((((_H_479_493:8.25300,((_H_448_462:7.25000,_L_409_411:7.25000):0.50000,_L_445_447:7.75000):0.50300):1.08808,(((((_E_381_382:2.65000,_E_377_378:2.65000):0.26434,_L_379_380:2.91434):1.77630,_L_373_376:4.69063):1.70029,_L_436_444:6.39093):0.93320,_L_383_391:7.32413):2.01696):0.94916,(((((_L_465_469:3.90000,_L_366_368:3.90000):1.52226,_H_463_464:5.42226):0.94093,(_E_427_435:5.15000,_E_369_372:5.15000):1.21319):1.64489,_L_336_343:8.00808):0.88402,(((_H_355_365:6.20000,_L_349_354:6.20000):0.91541,(_L_327_328:3.40000,_L_318_326:3.40000):3.71541):0.59082,(((((_E_470_474:3.85000,_E_344_348:3.
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Shameer Khadar
Prof. R. Sowdhamini's Lab (# 25) The Computational Biology Group
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