[Bioperl-l] format checking

[Guido Dieterich]

Hi bioperlaner,

         
            <code>$seqIO = Bio::SeqIO->new(-fh   => \*FH,
        -format=>'fasta');</code>
        I tried this 
        as a fasta file 
        
        gene_name>
        PPPPGGGAAAAA # any Sequence
        
        this does not create an error
        
        does the  Bio::SeqIO checks if a file or filehandle is in the
        appr opiate format,eg. a fasta format?
        It seems that not, or?
        
        Guido

-- 
			
			
Dr. Guido Dieterich                                    
Dipl.-Biologe										      

BioComputing                                                									 											 
SB  - Strukturbiologie                                     \==-|	   
GBF - Gesellschaft fuer Biotechnologische Forschung         \=/   0010010010100101110010
      German Research Centre for Biotechnology		    /-\ 	   
                                                           /-==|  0010100100111101010010
WWW: http://www.gbf.de         _/_/_/   _/_/_/   _/_/_/   |==-/ 	   
EMAIL: gdi at gbf.de            _/    _/  _/   _/  _/	   \=/    0100100100010010010101
                            _/        _/   _/  _/          /\  	   
Mascheroder Weg 1          _/  _/    _/_/_/   _/_/_/      /=-\    1101001010100101010101
D-38124 Braunschweig      _/    _/  _/   _/  _/
Tel: +(49) 531 6181 745  _/    _/  _/   _/  _/
FAX: +(49) 531 2612 388   _/_/_/  _/_/_/   _/

http://www.gbf.de/sb


Es ist nicht genug, zu wissen, man muss auch anwenden.
Es ist nicht genug, zu wollen, man muss auch tun.
JOHANN WOLFGANG VON GOETHE
Deutscher Dichter
(1749 - 1832)