[Biojava-dev] org.biojava.bio.symbol.UkkonenSuffixTree.class BUG

[Caroline Renaux]

Bonjour,

j'ai récemment utilisé le Package org.biojava.bio.symbol et plus
particulièrement la classe UkkonenSuffixTree. Cependant lorsque que je veux
ajouter un ensemble de séquences à l'arbre et que je les sépares par le
caractère de séparation '$' celà ne fonctionne pas. Lorsqu'il traite la
seconde séquence j'obtiens une erreur "NullPointerException" dans la méthode
jumpTo à la ligne :

arrivedAt=(SuffixNode)currentNode.children.get(*new* Character(source.charAt
(from)));

Je ne comprend pas ce que j'aurai pu faire de travers.

D'avance merci de votre réponse.

RENAUX C.

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Hello,

I used for a java application the org.biojava.bio.symbol package and
particularly the UkkonenSuffixTree class. When i want to add a set of
sequences to the tree, i add a '$' between the sequences but it doesn't
work. I have a NullPointerException when the system add the second sequence
int the method jumTo at the line :

arrivedAt=(SuffixNode)currentNode.children.get(*new* Character(source.charAt
(from)));

I don't understand why it doesn't work.

Thank you in advance.

RENAUX C.