<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">

<html>

<head>

  <title>MOBY Scenarios</title>

  <meta http-equiv="content-type"

 content="text/html; charset=ISO-8859-1">

  <meta name="author" content="Fiona Cunningham">

</head>

  <body>

<br>

<h1>Wormbase Scenarios</h1>

<ul>

        <li><a HREF=#ScenarioWBseq>Wormbase Sequence Information</a></li>        

        <li><a HREF=#ScenarioWBenz>Wormbase Enzymes on ChromosomeIV </a></li>        

</ul>

<hr>

<h2><A NAME= ScenarioWBseq>Name: </a>Wormbase Sequence Information</h2>

<P><B>Scenario: </B>An investigator is interested in the hlh-1 locus in C.elegans.  He wants to find out which DNA and protein sequence names the locus corresponds to.He also wants to retrieve:

        <li>The spliced DNA sequence for each corresponding sequence.</li> 

        <li>The unspliced sequence but with indications of where the exons are located.</li>

        <li>The 500 base pairs upstream of the first exon.</li>    

        <li>The corresponding amino acid sequence.</li>

</ul>

</p>

<hr>

<h2><A NAME= ScenarioWBenz>Name: </a>Wormbase Enzymes</h2>

<P><B>Scenario: </B>An investigator would like to find all glycosyltransferases limited to chromosome IV.

</p>

<hr>

</body>

</html>