<HTML><BODY style="word-wrap: break-word; -khtml-nbsp-mode: space; -khtml-line-break: after-white-space; ">Robin, are you referring to the JemBoss installation?  And do you mean a standalone installation, or a server installation?<DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV><DIV>I've never had a problem installing Jemboss/EMBOSS (and the Embassy packages) standalone in Jaguar, Panther and now Tiger.  PNG support requires some additional efforts (FINK takes care of that, for me).  Jemboss 1.5 and EMBOSS 2.10.0 run fine on my powerbook under Tiger.</DIV><DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV><DIV>I always run the jemboos installer script to install everything (embassy included), and follow the Jemboss installation guide for OS X.  I also have it running fine on a dual-2.5GHz G5 running Panther 10.3.9.</DIV><DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV><DIV>When you update to Tiger, be sure to check the install option for the new X11, and then, install the developers tools and the new X11 SDK.  And with Tiger, do NOT point the jemboss install script to Java 1.5, stick with 1.4.2, or even 1.3.</DIV><DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV><DIV>Michael</DIV><DIV><DIV> <P style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px"><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">____________________________________________</FONT></P> <P style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px"><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">Michael B. Black, Ph.D.</FONT></P> <P style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px"><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">Molecular Biology Computing Support</FONT></P> <P style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px"><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">ITC-ACHS, MSB rm.3013</FONT></P> <P style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px"><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">982-4039</FONT></P> <P style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px"><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica"><A href="mailto:mblack@virginia.edu">mblack@virginia.edu</A></FONT></P> <P style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px; font: 12.0px Helvetica; min-height: 14.0px"><BR></P> <P style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px"><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">Web support, see the Molecular Biology</FONT></P> <P style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px"><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">section at: <A href="http://www.itc.virginia.edu/achs">http://www.itc.virginia.edu/achs</A></FONT></P> <P style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px"><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">____________________________________________</FONT></P>  </DIV><BR><DIV><DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV><DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV><DIV>On May 25, 2005, at 1:33 PM, Robin Colgrove wrote:</DIV><BR class="Apple-interchange-newline"><BLOCKQUOTE type="cite"><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Hello all,</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">After numerous attempts following suggestions on this list, I never have been able to get the X11 version of EMBOSS to install on my iBook under Mac OS X 10.3.8, but I installed and have been using the command line version without trouble (and using the GUI programs remotely with EMBOSS on a server and running the Mac X11 client locally).</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Next week I am going to upgrade to OSX 10.4 "Tiger", and was thinking of trying a full EMBOSS install again. I would be interested to hear from anyone who has done this (EMBOSS on Tiger) and any tips/advice. Also, it is not clear to me whether it would be best to uninstall everything and reinstall, or whether I could just install the X11 parts over an existing install.</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">thanks</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Robin Colgrove</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Dept of Microbiology</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Harvard Medical School</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV> <BR class="Apple-interchange-newline"></BLOCKQUOTE></DIV><BR></DIV></BODY></HTML>