<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
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<META http-equiv=Content-Type content="text/html; CHARSET=UTF-8">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1400" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Hi Carol,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>not every file but most are described in the README 
file from <A 
href="ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/codonusage">ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/codonusage</A>. 
Below I report the list I am using.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Regards</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Graziano</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Easn.cut  -  Aspergillus 
nidulans<BR>Eath.cut  -  Arabidopsis thaliana<BR>Ebly.cut  
-  Hordeum vulgare (Barley)<BR>Ebmo.cut  -  Bombyx mori (Silk 
Moth)<BR>Ebov.cut  -  Bos taurus (Cow)<BR>Ebsu.cut  -  
Bacillus subtilis<BR>Ecel.cut  -  Caenorhabditis 
elegans<BR>Echi.cut  -  Chironomus sp.<BR>Echk.cut  -  
Gallus sp. (Chicken)<BR>Eddi.cut  -  Dictyostelium 
discoideum<BR>Edro.cut  -  Drosophila melanogaster<BR>Eeco.cut  
-  Escherichia coli<BR>Eham.cut  -  Cricetulus sp. & 
Mesocricetus sp.(Hamster)<BR>Ehum.cut  -  Homo 
sapiens<BR>Ekpn.cut  -  Klebsiella pneumoniae<BR>Emac.cut  
-  Macaca sp<BR>Emus.cut  -  Mus sp. (Mouse)<BR>Emze.cut  
-  Zea mays (Maize)<BR>Emzecp.cut  -  Zea mays chloroplast 
(Maize)<BR>Eneu.cut  -  Neurospora crassa<BR>Engo.cut  -  
Neisseria gonorrheae<BR>Epea.cut  -  Pisum sativum 
(Pea)<BR>Epet.cut  -  Petunia sp.<BR>Epfa.cut  -  Plasmodium 
falciparum<BR>Ephv.cut  -  Phaseolus vulgaris (Lima 
bean)<BR>Epot.cut  -  Solanum tuberosum (Pototoe)<BR>Epse.cut  
-  Pseudomonas sp.<BR>Erab.cut  -  Oryctolagus sp. 
(Rabbit)<BR>Erat.cut  -  Rattus sp. (Rat)<BR>Erhm.cut  -  
Rhizobium meliloti<BR>Eric.cut  -  Oryza sativa 
(Rice)<BR>Eshp.cut  -  Ovis sp. (Sheep)<BR>Eslm.cut  -  
Physarum polycephalum<BR>Esoy.cut  -  Glycine max 
(Soybean)<BR>Esta.cut  -  Staphylococcus aureus<BR>Esty.cut  
-  Salmonella thphimurium<BR>Esus.cut  -  Strongylocentrotus 
purpuratus<BR>Etob.cut  -  Nicotiana tabacum 
(Tobacco)<BR>Etobcp.cut  -  Nicotiana tabacum chloroplast 
(Tobacco)<BR>Etom.cut  -  Lycopersicon esculentum 
(Tomato)<BR>Etrb.cut  -  Trypanosoma brucei<BR>Ewht.cut  -  
Triticum aestivum (Wheat)<BR>Exel.cut  -  Xenopus 
laevis<BR>Eysc.cut  -  Saccharomyces cerevisiae<BR>Eyscmt.cut  
-  Saccharomyces cerevisiae mitochondrion<BR>Eysp.cut  -  
Schizosaccharomyces pombe<BR></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>
<DIV>----- Original Message ----- </DIV>
<BLOCKQUOTE 
style="PADDING-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #000000 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV 
  style="BACKGROUND: #e4e4e4; FONT: 10pt arial; font-color: black"><B>From:</B> 
  <A title=louis@gtptech.com href="mailto:louis@gtptech.com">Carole Louis</A> 
  </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>To:</B> <A title=emboss@embnet.org 
  href="mailto:emboss@embnet.org">Liste Emboss</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Sent:</B> Tuesday, March 09, 2004 4:05 
  PM</DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Subject:</B> [EMBOSS] CUTG</DIV>
  <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT><FONT face=Arial size=2></FONT><FONT 
  face=Arial size=2></FONT><FONT face=Arial size=2></FONT><BR></DIV>Hi,<BR><BR>I 
  extracted the CUTG database with cutgextract without any problem but I'd like 
  to have a more explicite name for my .cut files ? Is it possible to obtain it 
  ?<BR><BR>Thanks,<BR><BR>
  <TABLE cellSpacing=0 cellPadding=0 width="100%">
    <TBODY>
    <TR>
      <TD>-- <BR>Carole Louis <<A 
        href="mailto:louis@gtptech.com">louis@gtptech.com</A>><BR>GTP 
        Technology </TD></TR></TBODY></TABLE></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>