<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 5.5.2657.27">
<TITLE>problem to retrieve sequences with seqret after indexing the database</TITLE>
</HEAD>
<BODY>

<P><FONT SIZE=2>Dear all,</FONT>
</P>

<P><FONT SIZE=2>I have indexed a database with &quot;dbifasta&quot; and modified the &quot;.embossrc&quot; file:</FONT>
<BR><FONT SIZE=2>When I use the seqret command to retrieve the sequence, here is the error I got:</FONT>
</P>

<P><FONT SIZE=2>$ seqret Database:NC_005126</FONT>
<BR><FONT SIZE=2>Reads and writes (returns) sequences</FONT>
<BR><FONT SIZE=2>Error: Database Entry 'NC_005126' not found</FONT>
<BR><FONT SIZE=2>Error: Unable to read sequence 'Database:NC_005126'</FONT>
<BR><FONT SIZE=2>Died: seqret terminated: Bad value for option [sequence] and no prompt</FONT>
</P>

<P><FONT SIZE=2>But this sequence is present in the database file...</FONT>
</P>

<P><FONT SIZE=2>Do you know why I cannot find it ?</FONT>
</P>

<P><FONT SIZE=2>Thank you very much for your help...</FONT>
</P>

<P><FONT SIZE=2>Best regards</FONT>
</P>

<P><FONT SIZE=2>Caroline.</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>