<br><font size=2 face="sans-serif">Hello Burke,</font>
<br>
<br><font size=2 face="sans-serif">as it is with nearly all questions about EMBOSS the answer is YES.</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">Please have a look at the administration document written by Gary Williams at:</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">http://www.hgmp.mrc.ac.uk/Software/EMBOSS/Usa/databases.html</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">There you can find some examples about SRSWWW which allows you to load sequences directly from SRS servers somwhere in the world.</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">The more generic URL definition works with other types of servers (NCBI) to download sequences from there.</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">If even this does not solve your problem (e.g. if you are behind a firewall like me, snifff) you can always use the APP definition. This is simply a call to a local script. It should accept a single paramter and return the complete sequence entry on stdout.</font>
<br>
<br><font size=2 face="sans-serif">Hope this helps,</font>
<br>
<br><font size=2 face="sans-serif">David.</font>
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<br><font size=2 face="Courier New">Hello EMBOSSers,<br>
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Is it possible to extract genbank file information from an on-line database<br>
if I have an accession number or do I have to download the hundreds of<br>
genbank files locally and extract it from that? If so how? I have read<br>
information on seqret and it seems truly wonderful but it seems to work only<br>
with local databases?<br>
<br>
Thanks!<br>
<br>
Burke Squires<br>
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-- <br>
Burke Squires<br>
Bioinformatics<br>
MacroGenics, Inc.<br>
Dallas, TX<br>
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</font>
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