<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META content="text/html; charset=iso-8859-1" http-equiv=Content-Type>
<META content="MSHTML 5.00.2614.3500" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Hi all,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>I have a single file containing 164 sequences in 
embl format retrieved&nbsp;by SRS. I want to split all the entries in distinct 
files. I have tried to use "seqretsplit", but it do not report FT lines. For 
example:</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>My entry retrieved by means of SRS is:</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff face=Arial size=2>ID&nbsp;&nbsp; AY045754_4; parent: 
AY045754AC&nbsp;&nbsp; AY045754;<BR>FT&nbsp;&nbsp; 
rRNA&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 610. 
.772<BR>FT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
/product="5.8S ribosomal RNA"<BR>SQ&nbsp;&nbsp; Sequence&nbsp;&nbsp; 163 
BP;<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; TATATTCTAG CCTTATCGGT GGATCACTCG GCTCGTGGAT 
CGATGAAGAA CGCAGCCAAC&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
60<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; TGCGATAATT AGTGTGAACT GCAGAAACCT TGAACACTGA 
ACTTTCGAAT GCACATTGCG&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
120<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; CCATTGGAGT TATATCCATT GCACGCCTGG TTCAGGGTCG 
TAA&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
163<BR>//<BR></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>but seqretsplit convert it in:</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><FONT color=#0000ff>ID&nbsp;&nbsp; AY045754_4 
standard; DNA; UNC; 163 BP.<BR>SQ&nbsp;&nbsp; Sequence 163 BP; 43 A; 37 C; 39 G; 
44 T; 0 other;<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; TATATTCTAG CCTTATCGGT GGATCACTCG 
GCTCGTGGAT CGATGAAGAA CGCAGCCAAC&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
6<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; TGCGATAATT AGTGTGAACT GCAGAAACCT TGAACACTGA 
ACTTTCGAAT GCACATTGCG&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
12<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; CCATTGGAGT TATATCCATT GCACGCCTGG TTCAGGGTCG 
TAA&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
16<BR>//</FONT></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Anyone knows an application or a script that allows 
me to split sequences (embl format) in different files without losing FT 
lines?</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Best regards</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Graziano</DIV></FONT></BODY></HTML>