<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1106" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Hi,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>I am using EMBOSS via <FONT face="Times New Roman" 
size=3>Luke McCarthy's web interface. All other programs are working, 
</FONT></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><FONT face="Times New Roman" size=3>but 
</FONT></FONT><FONT face=Arial size=2>emma didn not work correctly.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>It gives an error:</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV>Error: failed to open filename 8808B Problem writing out EMBOSS alignment 
fileError: failed to open filename 8808B Problem writing out EMBOSS alignment 
file</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>It seems that by some reasón it can not create a 
file under runs/temp directory.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Why&nbsp;not -&nbsp; is&nbsp;for me 
unclea.&nbsp;&nbsp;All other files are there.&nbsp;</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Files under catalog&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
runs/<U><FONT color=#0000ff>fileVxWbES$/</FONT></U>) </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><A 
href="mailto:root@kobra:fileVxWbES$">root@kobra:fileVxWbES$</A> ls -l<BR>total 
16<BR>-rw-r--r--&nbsp;&nbsp; 1 www&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
java&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 915 Oct&nbsp; 7 20:51 
8825A<BR>-rw-r--r--&nbsp;&nbsp; 1 www&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
java&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0 
Oct&nbsp; 7 20:51 dendoutfile<BR>-rw-r--r--&nbsp;&nbsp; 1 
www&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
java&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 384 Oct&nbsp; 7 20:51 
error<BR>-rw-r--r--&nbsp;&nbsp; 1 www&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
java&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2145 Oct&nbsp; 7 20:51 
index.html<BR>drwxr-xr-x&nbsp;&nbsp; 2 www&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
java&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4096 Oct&nbsp; 7 20:51 
input<BR>-rw-r--r--&nbsp;&nbsp; 1 www&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
java&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0 
Oct&nbsp; 7 20:51 outseq<BR></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Command line clustalw works&nbsp; ok</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;<FONT face=Arial size=2></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Is there a solution for this problem?</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Tőnu Margus</FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV></BODY></HTML>