<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.2716.2200" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Hi all,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp;</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>It is not exactly &nbsp;emboss question but is 
related.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>I try to format EMBL rel 71.0 for blast 
</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>First&nbsp;step is &nbsp;converting &nbsp;in to 
&nbsp;FastA format&nbsp; I am &nbsp;using&nbsp;&nbsp; sp2fasta</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Unfortunately it can't&nbsp;manage files what are 
&nbsp;lager than&nbsp; 2GB </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>( I am running this stuff on Linux 2.4 Slackware 
8.0 )</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>And I didn't figure out how to send standard input 
as input for sp2fasta</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>( cat hum01.dat | sp2fasta didn't 
wokr)</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Does someone&nbsp;know how to overcome this 
problem?</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Is there some newer compilations of sp2fasta or 
some an other tool?</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Thanks in advance </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Tõnu Margus</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Estonian Biocentre </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Riia 23 </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Tartu 51010</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Estonia</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV></BODY></HTML>