From missy ＠ be.to  Mon Feb  2 19:58:23 2009
From: missy ＠ be.to (MISHIMA, Hiroyuki)
Date: Tue, 03 Feb 2009 09:58:23 +0900
Subject: [BioRuby-ja] =?iso-2022-jp?b?VHV0b3JpYWwucmQuanAbJEIkTjk5PzcbKEI=?=
	=?iso-2022-jp?b?GyRCJEskRCQkJEYbKEI=?=
Message-ID: <498796AF.7040904@be.to>

いつもBioRubyを重宝させていただいております。

BioRubyメーリングリストの方で，後藤さんからBioRuby 1.3.0のリリースが近い
とのアナウンスがありました。

http://github.com/bioruby/
のレポジトリをみてみたのですが，Tutrial.rd.jaが更新されていないようで
す。まあ，素直にTutrial.rdを読めばいいのですが，BioRuby shellの説明で，

	bioruby> dna = seq("atgcatgcaaaa")

という例が動かず

	bioruby> dna = getseq("atgcatgcaaaa")
	bioruby> seq = Bio::Sequence::NA.new("atgcatgcaaaa")

（後者はTutrial.rbより）
が正解というところで，しばらくはまった経験があるんで，この機会に更新でき
ればと思っています。

Tutorial.rbの翻訳であれば自分でもご協力できるかなと思うのですが，いかが
でしょうか？

三嶋博之
-- 
長崎大学大学院医歯薬学総合研究科人類遺伝学（原研遺伝）
三嶋　博之
MISHIMA, Hiroyuki, DDS, Ph.D.
COE Research Fellow
Department of Human Genetics
Nagasaki University Graduate School of Biomedical Sciences

From ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp  Tue Feb  3 06:04:40 2009
From: ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp (Naohisa GOTO)
Date: Tue, 3 Feb 2009 20:04:40 +0900
Subject: [BioRuby-ja]
 =?iso-2022-jp?b?VHV0b3JpYWwucmQuanAbJEIkTjk5PzcbKEI=?=
 =?iso-2022-jp?b?GyRCJEskRCQkJEYbKEI=?=
In-Reply-To: <498796AF.7040904@be.to>
References: <498796AF.7040904@be.to>
Message-ID: <20090203110441.B5ABC1CBC468@idnmail.gen-info.osaka-u.ac.jp>

後藤です。

On Tue, 03 Feb 2009 09:58:23 +0900
"MISHIMA, Hiroyuki" <missy ＠ be.to> wrote:

> いつもBioRubyを重宝させていただいております。
> 
> BioRubyメーリングリストの方で，後藤さんからBioRuby 1.3.0のリリースが近い
> とのアナウンスがありました。
> 
> http://github.com/bioruby/
> のレポジトリをみてみたのですが，Tutrial.rd.jaが更新されていないようで
> す。まあ，素直にTutrial.rdを読めばいいのですが，BioRuby shellの説明で，
> 
> 	bioruby> dna = seq("atgcatgcaaaa")
> 
> という例が動かず
> 
> 	bioruby> dna = getseq("atgcatgcaaaa")
> 	bioruby> seq = Bio::Sequence::NA.new("atgcatgcaaaa")
> 
> （後者はTutrial.rbより）
> が正解というところで，しばらくはまった経験があるんで，この機会に更新でき
> ればと思っています。

BioRuby 1.1.0 以降 (正確には 1.1.0-pre1以降) では、
seq, ent, obj は getseq, getent, getobj に改名されました。
その理由は、汎用的すぎる単語のため、変数名と重なった場合に混乱する
からだったと思います。git上では以下の変更です。

> commit 0235841dac7c7812cdc056b51d3f42028397bedb
> Author: Toshiaki Katayama <k ＠ bioruby.org>
> Date:   Sun Dec 24 08:50:18 2006 +0000
> 
>     * seq, ent, obj commands are changed to getseq, getent, getobj respectively

しかし、それにドキュメントが追いついていなかったようです。
とりあえず Tutorial.rd.ja については修正しておきました。
ついでに、他に気になる点も、すぐに直せる所については修正しました。

http://github.com/ngoto/bioruby/commit/9ed31bb0b7a1c9f32f621376965180a202c6a404
(文字コードを euc-jp にすれば文字化けせずに表示できます。)

なお、BioRuby shellについての記述は、おそらく日本語版独自の
内容だと思います。Tutorial.rd には相当する部分は無さそうでした。

> Tutorial.rbの翻訳であれば自分でもご協力できるかなと思うのですが，いかが
> でしょうか？

元々 Tutorial.rd は Tutorial.rd.ja を翻訳したものでしたが、
その後、両者がそれぞれ独自に追加と修正を繰り返してしまっています。
つまり、片方向ではなく双方向の内容のマッチングと翻訳が必要ですが、
お願いできるでしょうか？

-- 
後藤 直久  ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp
大阪大学微生物病研究所 遺伝情報実験センター ゲノム情報解析分野(安永研)


From missy ＠ be.to  Tue Feb  3 22:51:25 2009
From: missy ＠ be.to (MISHIMA, Hiroyuki)
Date: Wed, 04 Feb 2009 12:51:25 +0900
Subject: [BioRuby-ja]
 =?iso-2022-jp?b?VHV0b3JpYWwucmQuanAbJEIkTjk5PzcbKEI=?=
 =?iso-2022-jp?b?GyRCJEskRCQkJEYbKEI=?=
In-Reply-To: <20090203110441.B5ABC1CBC468@idnmail.gen-info.osaka-u.ac.jp>
References: <498796AF.7040904@be.to>
	<20090203110441.B5ABC1CBC468@idnmail.gen-info.osaka-u.ac.jp>
Message-ID: <498910BD.4070900@be.to>

三嶋＠長崎大原研遺伝です

英語版と日本語版をマージする感じですね。
Githubの使い方を勉強がてら，挑戦してみます。

三嶋博之

Naohisa GOTO 様からのメール (2009/02/03 20:04):
> 後藤です。
>> Tutorial.rbの翻訳であれば自分でもご協力できるかなと思うのですが，いかが
>> でしょうか？
> 
> 元々 Tutorial.rd は Tutorial.rd.ja を翻訳したものでしたが、
> その後、両者がそれぞれ独自に追加と修正を繰り返してしまっています。
> つまり、片方向ではなく双方向の内容のマッチングと翻訳が必要ですが、
> お願いできるでしょうか？

-- 
長崎大学大学院医歯薬学総合研究科人類遺伝学（原研遺伝）
三嶋　博之
MISHIMA, Hiroyuki, DDS, Ph.D.
COE Research Fellow
Department of Human Genetics
Nagasaki University Graduate School of Biomedical Sciences

From ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp  Tue Feb 24 11:39:48 2009
From: ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp (Naohisa Goto)
Date: Wed, 25 Feb 2009 01:39:48 +0900
Subject: [BioRuby-ja] BioRuby 1.3.0 is released
Message-ID: <20090225013049.650B.EEF6E030@gen-info.osaka-u.ac.jp>

Hi all,

We are pleased to announce the release of BioRuby 1.3.0.

The archive is available at:
  http://bioruby.org/archive/bioruby-1.3.0.tar.gz

Web page:
  http://bioruby.org/
  http://bioruby.open-bio.org/
API documentation:
  http://bioruby.org/rdoc/
Bug report:
  http://rubyforge.org/projects/bioruby/

(Updating of http://bioruby.rubyforge.org/ is still
in progress. Please wait for a moment.)

We also put RubyGems pacakge at RubyForge as always.
You can easily install by using RubyGems.
 % sudo gem install bio

You can also obtain bioruby gem file from bioruby.org.
  http://bioruby.org/archive/gems/bio-1.3.0.gem

Here is a brief summary of changes.

  * Support for GenBank/EMBL formatted sequence output with
    improvements of Bio::Sequence.
  * BioSQL support is completely rewritten by using ActiveRecord. 
  * Bio::Blast bug fixes and improvements.
  * Bio::GFF::GFF2 and Bio::GFF::GFF3 improvements.
  * Bio::Locations improvements.
  * New classes and modules.
    * Bio::Hinv
    * Bio::NCBI::REST
    * Bio::PAML::Codeml
    * Bio::TogoWS::REST

In addition, many changes have been made, including incompatible changes.
For more information, you can see summary of changes at
http://github.com/bioruby/bioruby/blob/e04da7a1e709195d0b3e957491e76e50af32e96d/doc/Changes-1.3.rdoc

and ChangeLog at

http://github.com/ngoto/bioruby/blob/27a31e1fa7e916ee2af09eeba992eea5a3ca6fbd/ChangeLog

In ChangeLog, the release date is described as 20 Feb 2009, which
indicates frozen date of the archive. I'm sorry I took much time
for the final check of the archive contents.

Hope you enjoy.


Naohisa Goto
ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp / ng ＠ bioruby.org


From ktym ＠ hgc.jp  Tue Feb 24 13:52:17 2009
From: ktym ＠ hgc.jp (Toshiaki Katayama)
Date: Wed, 25 Feb 2009 03:52:17 +0900
Subject: [BioRuby-ja] [BioRuby] BioRuby 1.3.0 is released
In-Reply-To: <20090225013049.650B.EEF6E030@gen-info.osaka-u.ac.jp>
References: <20090225013049.650B.EEF6E030@gen-info.osaka-u.ac.jp>
Message-ID: <185DEF56-A1BA-4752-9E58-B0C3E0C4DFA5@hgc.jp>

Goto-san,

Thank you for your wonderful works on this release.

Just note that we've updated the BioRuby web sites:

> Web page:
>  http://bioruby.org/

This site is our project top page as in the past.

>  http://bioruby.open-bio.org/


This remains as our mirror site.

The new site design had actually been at the mirror site
for one year and we finally bring it to the main site
(beautiful icons are courtesy of Okamoto-san).


Additionally, I have edited the structure of our Wiki site at

http://bioruby.open-bio.org/wiki/

extensively to clarify the contents in it. I've also added a new
page for BioRuby on Rails.

Regards,
Toshiaki Katayama

On 2009/02/25, at 1:39, Naohisa Goto wrote:

> Hi all,
>
> We are pleased to announce the release of BioRuby 1.3.0.
>
> The archive is available at:
>  http://bioruby.org/archive/bioruby-1.3.0.tar.gz
>
> Web page:
>  http://bioruby.org/
>  http://bioruby.open-bio.org/
> API documentation:
>  http://bioruby.org/rdoc/
> Bug report:
>  http://rubyforge.org/projects/bioruby/
>
> (Updating of http://bioruby.rubyforge.org/ is still
> in progress. Please wait for a moment.)
>
> We also put RubyGems pacakge at RubyForge as always.
> You can easily install by using RubyGems.
> % sudo gem install bio
>
> You can also obtain bioruby gem file from bioruby.org.
>  http://bioruby.org/archive/gems/bio-1.3.0.gem
>
> Here is a brief summary of changes.
>
>  * Support for GenBank/EMBL formatted sequence output with
>    improvements of Bio::Sequence.
>  * BioSQL support is completely rewritten by using ActiveRecord. 
>  * Bio::Blast bug fixes and improvements.
>  * Bio::GFF::GFF2 and Bio::GFF::GFF3 improvements.
>  * Bio::Locations improvements.
>  * New classes and modules.
>    * Bio::Hinv
>    * Bio::NCBI::REST
>    * Bio::PAML::Codeml
>    * Bio::TogoWS::REST
>
> In addition, many changes have been made, including incompatible changes.
> For more information, you can see summary of changes at
> http://github.com/bioruby/bioruby/blob/e04da7a1e709195d0b3e957491e76e50af32e96d/doc/Changes-1.3.rdoc
>
> and ChangeLog at
>
> http://github.com/ngoto/bioruby/blob/27a31e1fa7e916ee2af09eeba992eea5a3ca6fbd/ChangeLog
>
> In ChangeLog, the release date is described as 20 Feb 2009, which
> indicates frozen date of the archive. I'm sorry I took much time
> for the final check of the archive contents.
>
> Hope you enjoy.
>
>
> Naohisa Goto
> ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp / ng ＠ bioruby.org
>
> _______________________________________________
> BioRuby mailing list
> BioRuby ＠ lists.open-bio.org
> http://lists.open-bio.org/mailman/listinfo/bioruby


From missy ＠ be.to  Tue Feb  3 00:58:23 2009
From: missy ＠ be.to (MISHIMA, Hiroyuki)
Date: Tue, 03 Feb 2009 09:58:23 +0900
Subject: [BioRuby-ja] =?iso-2022-jp?b?VHV0b3JpYWwucmQuanAbJEIkTjk5PzcbKEI=?=
	=?iso-2022-jp?b?GyRCJEskRCQkJEYbKEI=?=
Message-ID: <498796AF.7040904@be.to>

いつもBioRubyを重宝させていただいております。

BioRubyメーリングリストの方で，後藤さんからBioRuby 1.3.0のリリースが近い
とのアナウンスがありました。

http://github.com/bioruby/
のレポジトリをみてみたのですが，Tutrial.rd.jaが更新されていないようで
す。まあ，素直にTutrial.rdを読めばいいのですが，BioRuby shellの説明で，

	bioruby> dna = seq("atgcatgcaaaa")

という例が動かず

	bioruby> dna = getseq("atgcatgcaaaa")
	bioruby> seq = Bio::Sequence::NA.new("atgcatgcaaaa")

（後者はTutrial.rbより）
が正解というところで，しばらくはまった経験があるんで，この機会に更新でき
ればと思っています。

Tutorial.rbの翻訳であれば自分でもご協力できるかなと思うのですが，いかが
でしょうか？

三嶋博之
-- 
長崎大学大学院医歯薬学総合研究科人類遺伝学（原研遺伝）
三嶋　博之
MISHIMA, Hiroyuki, DDS, Ph.D.
COE Research Fellow
Department of Human Genetics
Nagasaki University Graduate School of Biomedical Sciences


From ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp  Tue Feb  3 11:04:40 2009
From: ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp (Naohisa GOTO)
Date: Tue, 3 Feb 2009 20:04:40 +0900
Subject: [BioRuby-ja]
 =?iso-2022-jp?b?VHV0b3JpYWwucmQuanAbJEIkTjk5PzcbKEI=?=
 =?iso-2022-jp?b?GyRCJEskRCQkJEYbKEI=?=
In-Reply-To: <498796AF.7040904@be.to>
References: <498796AF.7040904@be.to>
Message-ID: <20090203110441.B5ABC1CBC468@idnmail.gen-info.osaka-u.ac.jp>

後藤です。

On Tue, 03 Feb 2009 09:58:23 +0900
"MISHIMA, Hiroyuki" <missy ＠ be.to> wrote:

> いつもBioRubyを重宝させていただいております。
> 
> BioRubyメーリングリストの方で，後藤さんからBioRuby 1.3.0のリリースが近い
> とのアナウンスがありました。
> 
> http://github.com/bioruby/
> のレポジトリをみてみたのですが，Tutrial.rd.jaが更新されていないようで
> す。まあ，素直にTutrial.rdを読めばいいのですが，BioRuby shellの説明で，
> 
> 	bioruby> dna = seq("atgcatgcaaaa")
> 
> という例が動かず
> 
> 	bioruby> dna = getseq("atgcatgcaaaa")
> 	bioruby> seq = Bio::Sequence::NA.new("atgcatgcaaaa")
> 
> （後者はTutrial.rbより）
> が正解というところで，しばらくはまった経験があるんで，この機会に更新でき
> ればと思っています。

BioRuby 1.1.0 以降 (正確には 1.1.0-pre1以降) では、
seq, ent, obj は getseq, getent, getobj に改名されました。
その理由は、汎用的すぎる単語のため、変数名と重なった場合に混乱する
からだったと思います。git上では以下の変更です。

> commit 0235841dac7c7812cdc056b51d3f42028397bedb
> Author: Toshiaki Katayama <k ＠ bioruby.org>
> Date:   Sun Dec 24 08:50:18 2006 +0000
> 
>     * seq, ent, obj commands are changed to getseq, getent, getobj respectively

しかし、それにドキュメントが追いついていなかったようです。
とりあえず Tutorial.rd.ja については修正しておきました。
ついでに、他に気になる点も、すぐに直せる所については修正しました。

http://github.com/ngoto/bioruby/commit/9ed31bb0b7a1c9f32f621376965180a202c6a404
(文字コードを euc-jp にすれば文字化けせずに表示できます。)

なお、BioRuby shellについての記述は、おそらく日本語版独自の
内容だと思います。Tutorial.rd には相当する部分は無さそうでした。

> Tutorial.rbの翻訳であれば自分でもご協力できるかなと思うのですが，いかが
> でしょうか？

元々 Tutorial.rd は Tutorial.rd.ja を翻訳したものでしたが、
その後、両者がそれぞれ独自に追加と修正を繰り返してしまっています。
つまり、片方向ではなく双方向の内容のマッチングと翻訳が必要ですが、
お願いできるでしょうか？

-- 
後藤 直久  ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp
大阪大学微生物病研究所 遺伝情報実験センター ゲノム情報解析分野(安永研)



From missy ＠ be.to  Wed Feb  4 03:51:25 2009
From: missy ＠ be.to (MISHIMA, Hiroyuki)
Date: Wed, 04 Feb 2009 12:51:25 +0900
Subject: [BioRuby-ja]
 =?iso-2022-jp?b?VHV0b3JpYWwucmQuanAbJEIkTjk5PzcbKEI=?=
 =?iso-2022-jp?b?GyRCJEskRCQkJEYbKEI=?=
In-Reply-To: <20090203110441.B5ABC1CBC468@idnmail.gen-info.osaka-u.ac.jp>
References: <498796AF.7040904@be.to>
	<20090203110441.B5ABC1CBC468@idnmail.gen-info.osaka-u.ac.jp>
Message-ID: <498910BD.4070900@be.to>

三嶋＠長崎大原研遺伝です

英語版と日本語版をマージする感じですね。
Githubの使い方を勉強がてら，挑戦してみます。

三嶋博之

Naohisa GOTO 様からのメール (2009/02/03 20:04):
> 後藤です。
>> Tutorial.rbの翻訳であれば自分でもご協力できるかなと思うのですが，いかが
>> でしょうか？
> 
> 元々 Tutorial.rd は Tutorial.rd.ja を翻訳したものでしたが、
> その後、両者がそれぞれ独自に追加と修正を繰り返してしまっています。
> つまり、片方向ではなく双方向の内容のマッチングと翻訳が必要ですが、
> お願いできるでしょうか？

-- 
長崎大学大学院医歯薬学総合研究科人類遺伝学（原研遺伝）
三嶋　博之
MISHIMA, Hiroyuki, DDS, Ph.D.
COE Research Fellow
Department of Human Genetics
Nagasaki University Graduate School of Biomedical Sciences


From ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp  Tue Feb 24 16:39:48 2009
From: ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp (Naohisa Goto)
Date: Wed, 25 Feb 2009 01:39:48 +0900
Subject: [BioRuby-ja] BioRuby 1.3.0 is released
Message-ID: <20090225013049.650B.EEF6E030@gen-info.osaka-u.ac.jp>

Hi all,

We are pleased to announce the release of BioRuby 1.3.0.

The archive is available at:
  http://bioruby.org/archive/bioruby-1.3.0.tar.gz

Web page:
  http://bioruby.org/
  http://bioruby.open-bio.org/
API documentation:
  http://bioruby.org/rdoc/
Bug report:
  http://rubyforge.org/projects/bioruby/

(Updating of http://bioruby.rubyforge.org/ is still
in progress. Please wait for a moment.)

We also put RubyGems pacakge at RubyForge as always.
You can easily install by using RubyGems.
 % sudo gem install bio

You can also obtain bioruby gem file from bioruby.org.
  http://bioruby.org/archive/gems/bio-1.3.0.gem

Here is a brief summary of changes.

  * Support for GenBank/EMBL formatted sequence output with
    improvements of Bio::Sequence.
  * BioSQL support is completely rewritten by using ActiveRecord. 
  * Bio::Blast bug fixes and improvements.
  * Bio::GFF::GFF2 and Bio::GFF::GFF3 improvements.
  * Bio::Locations improvements.
  * New classes and modules.
    * Bio::Hinv
    * Bio::NCBI::REST
    * Bio::PAML::Codeml
    * Bio::TogoWS::REST

In addition, many changes have been made, including incompatible changes.
For more information, you can see summary of changes at
http://github.com/bioruby/bioruby/blob/e04da7a1e709195d0b3e957491e76e50af32e96d/doc/Changes-1.3.rdoc

and ChangeLog at

http://github.com/ngoto/bioruby/blob/27a31e1fa7e916ee2af09eeba992eea5a3ca6fbd/ChangeLog

In ChangeLog, the release date is described as 20 Feb 2009, which
indicates frozen date of the archive. I'm sorry I took much time
for the final check of the archive contents.

Hope you enjoy.


Naohisa Goto
ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp / ng ＠ bioruby.org



From ktym ＠ hgc.jp  Tue Feb 24 18:52:17 2009
From: ktym ＠ hgc.jp (Toshiaki Katayama)
Date: Wed, 25 Feb 2009 03:52:17 +0900
Subject: [BioRuby-ja] [BioRuby] BioRuby 1.3.0 is released
In-Reply-To: <20090225013049.650B.EEF6E030@gen-info.osaka-u.ac.jp>
References: <20090225013049.650B.EEF6E030@gen-info.osaka-u.ac.jp>
Message-ID: <185DEF56-A1BA-4752-9E58-B0C3E0C4DFA5@hgc.jp>

Goto-san,

Thank you for your wonderful works on this release.

Just note that we've updated the BioRuby web sites:

> Web page:
>  http://bioruby.org/

This site is our project top page as in the past.

>  http://bioruby.open-bio.org/


This remains as our mirror site.

The new site design had actually been at the mirror site
for one year and we finally bring it to the main site
(beautiful icons are courtesy of Okamoto-san).


Additionally, I have edited the structure of our Wiki site at

http://bioruby.open-bio.org/wiki/

extensively to clarify the contents in it. I've also added a new
page for BioRuby on Rails.

Regards,
Toshiaki Katayama

On 2009/02/25, at 1:39, Naohisa Goto wrote:

> Hi all,
>
> We are pleased to announce the release of BioRuby 1.3.0.
>
> The archive is available at:
>  http://bioruby.org/archive/bioruby-1.3.0.tar.gz
>
> Web page:
>  http://bioruby.org/
>  http://bioruby.open-bio.org/
> API documentation:
>  http://bioruby.org/rdoc/
> Bug report:
>  http://rubyforge.org/projects/bioruby/
>
> (Updating of http://bioruby.rubyforge.org/ is still
> in progress. Please wait for a moment.)
>
> We also put RubyGems pacakge at RubyForge as always.
> You can easily install by using RubyGems.
> % sudo gem install bio
>
> You can also obtain bioruby gem file from bioruby.org.
>  http://bioruby.org/archive/gems/bio-1.3.0.gem
>
> Here is a brief summary of changes.
>
>  * Support for GenBank/EMBL formatted sequence output with
>    improvements of Bio::Sequence.
>  * BioSQL support is completely rewritten by using ActiveRecord. 
>  * Bio::Blast bug fixes and improvements.
>  * Bio::GFF::GFF2 and Bio::GFF::GFF3 improvements.
>  * Bio::Locations improvements.
>  * New classes and modules.
>    * Bio::Hinv
>    * Bio::NCBI::REST
>    * Bio::PAML::Codeml
>    * Bio::TogoWS::REST
>
> In addition, many changes have been made, including incompatible changes.
> For more information, you can see summary of changes at
> http://github.com/bioruby/bioruby/blob/e04da7a1e709195d0b3e957491e76e50af32e96d/doc/Changes-1.3.rdoc
>
> and ChangeLog at
>
> http://github.com/ngoto/bioruby/blob/27a31e1fa7e916ee2af09eeba992eea5a3ca6fbd/ChangeLog
>
> In ChangeLog, the release date is described as 20 Feb 2009, which
> indicates frozen date of the archive. I'm sorry I took much time
> for the final check of the archive contents.
>
> Hope you enjoy.
>
>
> Naohisa Goto
> ngoto ＠ gen-info.osaka-u.ac.jp / ng ＠ bioruby.org
>
> _______________________________________________
> BioRuby mailing list
> BioRuby ＠ lists.open-bio.org
> http://lists.open-bio.org/mailman/listinfo/bioruby